不影响 。
升级迁移期间，单位和个人医保缴费不停，税务部门正常办理已核定参保单位和个人的医保缴费业务 。
6月27日起，用人单位凭新注册登记的账号登录市医疗保障局网站可正常办理业务 。
【南京医保系统参保业务暂停影响缴费吗】拓展阅读：异地就医可享受的待遇
省内联网医院就诊：职工医保门特、门慢、门统、住院，居民医保门诊大病、门诊统筹、两病、门诊高费用补偿和住院可直接结算，按照“南京政策和目录”享受待遇;
省外联网医院就诊：
(一)职工医保和居民医保住院均可直接结算;
(二)职工医保和居民医保门诊可在跨省联网试点地区的联网医院直接结算费用 。
住院和门诊异地刷卡结算费用按照“南京政策、就医地目录”享受待遇 。

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